Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRX6P78412 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRX6P78412 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRX6P78412 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRX6P78412 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRX6P78412 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRX6P78412 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRX6P78412 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRX6P78412 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX6P78412 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX6P78412 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX6P78412 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX6P78412 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX6P78412 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX6P78412 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX6P78412 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX6P78412 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX6P78412 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX6P78412 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX6P78412 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX6P78412 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX6P78412 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX6P78412 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX6P78412 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX6P78412 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX6P78412 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX6P78412 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX6P78412 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX6P78412 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX6P78412 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX6P78412 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX6P78412 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX6P78412 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX6P78412 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX6P78412 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX6P78412 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX6P78412 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX6P78412 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX6P78412 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX6P78412 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX6P78412 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX6P78412 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX6P78412 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX6P78412 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX6P78412 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX6P78412 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX6P78412 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX6P78412 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX6P78412 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX6P78412 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX6P78412 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX6P78412 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX6P78412 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX6P78412 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX6P78412 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX6P78412 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX6P78412 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX6P78412 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX6P78412 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX6P78412 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX6P78412 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX6P78412 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX6P78412 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX6P78412 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX6P78412 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX6P78412 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX6P78412 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX6P78412 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX6P78412 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX6P78412 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX6P78412 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX6P78412 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX6P78412 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX6P78412 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX6P78412 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX6P78412 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX6P78412 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX6P78412 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX6P78412 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX6P78412 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX6P78412 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX6P78412 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX6P78412 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX6P78412 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX6P78412 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX6P78412 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX6P78412 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX6P78412 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX6P78412 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX6P78412 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX6P78412 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX6P78412 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX6P78412 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IRX6P78412 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IRX6P78412 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IRX6P78412 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IRX6P78412 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IRX6P78412 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IRX6P78412 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRX6P78412 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms