Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC10Q9NYD6 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms