Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL4Q9C0H6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL4Q9C0H6 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms