Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV29

CCDC32, Coiled-coil domain-containing protein 32, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC32Q9BV29 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC32Q9BV29 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms