Protein–RNA interactions for Protein: Q99684

GFI1, Zinc finger protein Gfi-1, humanhuman

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1Q99684 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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GFI1Q99684 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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GFI1Q99684 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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GFI1Q99684 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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GFI1Q99684 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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GFI1Q99684 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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GFI1Q99684 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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GFI1Q99684 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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GFI1Q99684 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFI1Q99684 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFI1Q99684 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFI1Q99684 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFI1Q99684 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFI1Q99684 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFI1Q99684 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFI1Q99684 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFI1Q99684 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFI1Q99684 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFI1Q99684 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFI1Q99684 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFI1Q99684 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFI1Q99684 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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