Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms