Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms