Protein–RNA interactions for Protein: Q5YKI7

GGNBP1, Putative gametogenetin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP1Q5YKI7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GGNBP1Q5YKI7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GGNBP1Q5YKI7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GGNBP1Q5YKI7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GGNBP1Q5YKI7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
GGNBP1Q5YKI7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
GGNBP1Q5YKI7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
GGNBP1Q5YKI7 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GGNBP1Q5YKI7 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GGNBP1Q5YKI7 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
GGNBP1Q5YKI7 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GGNBP1Q5YKI7 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GGNBP1Q5YKI7 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GGNBP1Q5YKI7 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GGNBP1Q5YKI7 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GGNBP1Q5YKI7 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GGNBP1Q5YKI7 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GGNBP1Q5YKI7 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GGNBP1Q5YKI7 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GGNBP1Q5YKI7 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GGNBP1Q5YKI7 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GGNBP1Q5YKI7 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GGNBP1Q5YKI7 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GGNBP1Q5YKI7 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GGNBP1Q5YKI7 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GGNBP1Q5YKI7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GGNBP1Q5YKI7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GGNBP1Q5YKI7 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GGNBP1Q5YKI7 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GGNBP1Q5YKI7 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GGNBP1Q5YKI7 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GGNBP1Q5YKI7 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GGNBP1Q5YKI7 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GGNBP1Q5YKI7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GGNBP1Q5YKI7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GGNBP1Q5YKI7 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GGNBP1Q5YKI7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GGNBP1Q5YKI7 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GGNBP1Q5YKI7 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GGNBP1Q5YKI7 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GGNBP1Q5YKI7 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GGNBP1Q5YKI7 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GGNBP1Q5YKI7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms