Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms