Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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SNAPC1Q16533 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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SNAPC1Q16533 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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SNAPC1Q16533 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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SNAPC1Q16533 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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SNAPC1Q16533 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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SNAPC1Q16533 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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SNAPC1Q16533 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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SNAPC1Q16533 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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SNAPC1Q16533 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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SNAPC1Q16533 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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