Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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