Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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BRD3Q15059 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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BRD3Q15059 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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BRD3Q15059 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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BRD3Q15059 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
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BRD3Q15059 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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BRD3Q15059 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
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