Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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TUBA3CQ13748 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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TUBA3CQ13748 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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TUBA3CQ13748 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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TUBA3CQ13748 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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TUBA3CQ13748 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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TUBA3CQ13748 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
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