Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms