Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZBED6P86452 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms