Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS28P62857 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS28P62857 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS28P62857 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS28P62857 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS28P62857 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS28P62857 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS28P62857 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS28P62857 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS28P62857 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS28P62857 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPS28P62857 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS28P62857 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS28P62857 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS28P62857 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS28P62857 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS28P62857 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS28P62857 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS28P62857 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS28P62857 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS28P62857 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS28P62857 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS28P62857 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS28P62857 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS28P62857 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS28P62857 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS28P62857 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS28P62857 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS28P62857 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS28P62857 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS28P62857 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS28P62857 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS28P62857 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS28P62857 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS28P62857 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS28P62857 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS28P62857 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS28P62857 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS28P62857 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS28P62857 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS28P62857 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS28P62857 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS28P62857 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS28P62857 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS28P62857 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS28P62857 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS28P62857 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS28P62857 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS28P62857 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS28P62857 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS28P62857 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS28P62857 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS28P62857 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS28P62857 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS28P62857 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS28P62857 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS28P62857 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS28P62857 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS28P62857 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS28P62857 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS28P62857 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS28P62857 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS28P62857 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RPS28P62857 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms