Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCE1P61221 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms