Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms