Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTDSS1P48651 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms