Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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