Protein–RNA interactions for Protein: O43711

TLX3, T-cell leukemia homeobox protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLX3O43711 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLX3O43711 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLX3O43711 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLX3O43711 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLX3O43711 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLX3O43711 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLX3O43711 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLX3O43711 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLX3O43711 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLX3O43711 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLX3O43711 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLX3O43711 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TLX3O43711 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TLX3O43711 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLX3O43711 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLX3O43711 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TLX3O43711 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLX3O43711 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLX3O43711 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLX3O43711 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLX3O43711 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLX3O43711 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLX3O43711 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLX3O43711 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLX3O43711 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLX3O43711 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLX3O43711 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLX3O43711 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLX3O43711 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLX3O43711 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLX3O43711 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLX3O43711 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLX3O43711 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLX3O43711 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TLX3O43711 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLX3O43711 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TLX3O43711 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLX3O43711 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLX3O43711 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLX3O43711 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLX3O43711 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLX3O43711 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLX3O43711 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLX3O43711 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLX3O43711 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLX3O43711 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLX3O43711 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLX3O43711 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLX3O43711 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLX3O43711 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLX3O43711 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLX3O43711 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLX3O43711 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLX3O43711 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLX3O43711 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLX3O43711 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TLX3O43711 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLX3O43711 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLX3O43711 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLX3O43711 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLX3O43711 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLX3O43711 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLX3O43711 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLX3O43711 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLX3O43711 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLX3O43711 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLX3O43711 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLX3O43711 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLX3O43711 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLX3O43711 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLX3O43711 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TLX3O43711 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TLX3O43711 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TLX3O43711 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TLX3O43711 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TLX3O43711 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TLX3O43711 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TLX3O43711 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TLX3O43711 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TLX3O43711 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TLX3O43711 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TLX3O43711 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TLX3O43711 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TLX3O43711 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TLX3O43711 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TLX3O43711 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TLX3O43711 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TLX3O43711 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TLX3O43711 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TLX3O43711 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TLX3O43711 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TLX3O43711 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TLX3O43711 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TLX3O43711 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TLX3O43711 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TLX3O43711 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TLX3O43711 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TLX3O43711 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TLX3O43711 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TLX3O43711 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms