Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD9

UBQLN2, Ubiquilin-2, humanhuman

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN2Q9UHD9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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UBQLN2Q9UHD9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBQLN2Q9UHD9 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBQLN2Q9UHD9 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBQLN2Q9UHD9 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBQLN2Q9UHD9 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBQLN2Q9UHD9 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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