Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6H4

REEP4, Receptor expression-enhancing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP4Q9H6H4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
REEP4Q9H6H4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
REEP4Q9H6H4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
REEP4Q9H6H4 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
REEP4Q9H6H4 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
REEP4Q9H6H4 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
REEP4Q9H6H4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
REEP4Q9H6H4 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
REEP4Q9H6H4 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
REEP4Q9H6H4 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
REEP4Q9H6H4 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
REEP4Q9H6H4 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
REEP4Q9H6H4 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
REEP4Q9H6H4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
REEP4Q9H6H4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
REEP4Q9H6H4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
REEP4Q9H6H4 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
REEP4Q9H6H4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
REEP4Q9H6H4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
REEP4Q9H6H4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
REEP4Q9H6H4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
REEP4Q9H6H4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
REEP4Q9H6H4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
REEP4Q9H6H4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
REEP4Q9H6H4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
REEP4Q9H6H4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
REEP4Q9H6H4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
REEP4Q9H6H4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
REEP4Q9H6H4 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
REEP4Q9H6H4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
REEP4Q9H6H4 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
REEP4Q9H6H4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
REEP4Q9H6H4 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.5 ms