Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms