Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms