Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMBR1LQ6UX01 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms