Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.053e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 PSMD2-219ENST00000492191 581 ntTSL 214.58□□□□□ -0.083e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.093e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 APBA2-210ENST00000559814 2555 ntTSL 1 (best)14.04□□□□□ -0.163e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 RIPK1-203ENST00000479389 1481 ntTSL 314.03□□□□□ -0.163e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.163e-9■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.193e-9■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 PLSCR1-208ENST00000472349 1198 ntTSL 513.76□□□□□ -0.213e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.213e-9■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 PNPLA8-212ENST00000489738 426 ntTSL 213.47□□□□□ -0.257e-17■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.263e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 THAP5-207ENST00000484452 1051 ntTSL 213□□□□□ -0.337e-17■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.373e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.378e-13■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.383e-9■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.393e-9■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 PLXNA3-209ENST00000497802 729 ntTSL 212.49□□□□□ -0.413e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.428e-13■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.473e-9■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.473e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.483e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 INTS14-217ENST00000573314 2615 ntTSL 1 (best)11.81□□□□□ -0.523e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 APBA2-201ENST00000382938 1954 ntTSL 211.67□□□□□ -0.543e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.563e-9■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 THAP5-208ENST00000493722 880 ntTSL 211.4□□□□□ -0.587e-17■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.613e-9■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 NRDE2-204ENST00000555903 1384 ntTSL 211.14□□□□□ -0.633e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 FP565260.1-203ENST00000623011 4564 ntTSL 211.06□□□□□ -0.643e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 PLSCR1-213ENST00000486631 701 ntTSL 510.98□□□□□ -0.653e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.663e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 THAP5-202ENST00000412935 783 ntTSL 510.73□□□□□ -0.697e-17■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.713e-9■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 USP20-209ENST00000496927 646 ntTSL 510.5□□□□□ -0.733e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 PLSCR1-203ENST00000462666 862 ntTSL 510.41□□□□□ -0.743e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 STYXL1-207ENST00000438695 764 ntTSL 1 (best)10.4□□□□□ -0.748e-13■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 STYXL1-205ENST00000430497 651 ntTSL 1 (best)10.4□□□□□ -0.748e-13■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 INTS14-203ENST00000431261 1980 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.793e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 STYXL1-206ENST00000431581 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.88e-13■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.83e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 APBA2-204ENST00000558259 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.853e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 INTS14-202ENST00000420799 1741 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.863e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 APBA2-202ENST00000411764 3599 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.913e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 FP565260.1-201ENST00000617716 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.953e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 THAP5-201ENST00000313516 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.957e-17■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 LAMB1-204ENST00000393561 5766 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.973e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 THAP5-203ENST00000415914 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.987e-17■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 STYXL1-202ENST00000340062 953 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.028e-13■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 INTS14-215ENST00000569491 1797 ntTSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.113e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 POLR1A-203ENST00000409681 6454 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.121e-6■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 RBM5-213ENST00000464988 877 ntTSL 27.35□□□□□ -1.233e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.291e-6■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 ANXA1-206ENST00000489109 749 ntTSL 25.8□□□□□ -1.483e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 THAP5-206ENST00000468884 425 ntTSL 35.79□□□□□ -1.487e-17■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.543e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.573e-9■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 CCT2-204ENST00000546850 364 ntTSL 24.96□□□□□ -1.622e-9■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 CCT2-206ENST00000548787 852 ntTSL 24.24□□□□□ -1.733e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 DONSON-208ENST00000442660 1566 ntTSL 1 (best)3.51□□□□□ -1.853e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.873e-9■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 STYXL1-209ENST00000454618 663 ntTSL 1 (best)3.33□□□□□ -1.888e-13■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 DONSON-207ENST00000440810 703 ntTSL 53.18□□□□□ -1.93e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.923e-9■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 DONSON-209ENST00000444517 1180 ntTSL 1 (best)2.94□□□□□ -1.943e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 UBE3A-210ENST00000626068 772 ntTSL 22.08□□□□□ -2.084e-12■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 UBE3A-216ENST00000628733 706 ntTSL 51.35□□□□□ -2.194e-12■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 CD46-210ENST00000462968 473 ntTSL 32.63□□□□□ -1.992e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 CD46-213ENST00000471987 572 ntTSL 31.29□□□□□ -2.22e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 CD46-215ENST00000488596 872 ntTSL 30.12□□□□□ -2.392e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 CD46-216ENST00000490278 747 ntTSL 2-0.53□□□□□ -2.492e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.312e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.382e-10■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 MMD-202ENST00000571578 670 ntTSL 314.84□□□□□ -0.032e-10■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.488e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 KLHL17-204ENST00000481067 515 ntTSL 212.76□□□□□ -0.372e-7■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.532e-6■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 GCLC-205ENST00000505294 847 ntTSL 34.29□□□□□ -1.722e-6■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 TARS2-210ENST00000467982 1855 ntTSL 513.04□□□□□ -0.324e-16■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 TARS2-212ENST00000480070 832 ntTSL 512.36□□□□□ -0.434e-16■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.534e-16■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 TARS2-201ENST00000369051 2106 ntTSL 511.19□□□□□ -0.624e-16■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 TARS2-205ENST00000438568 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.694e-16■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 TARS2-214ENST00000606933 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.734e-16■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 TARS2-204ENST00000369064 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.994e-16■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 SLC38A2-205ENST00000548236 865 ntTSL 21.97□□□□□ -2.091e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 C10orf76-204ENST00000470043 694 ntTSL 38.03□□□□□ -1.123e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 MTCH1-204ENST00000460219 1572 ntTSL 217.8■□□□□ 0.442e-7■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 AFG3L2-202ENST00000588893 3367 ntTSL 38.22□□□□□ -1.092e-13■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 ARHGAP17-202ENST00000303665 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.946e-9■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 ARHGAP17-201ENST00000289968 3461 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.996e-9■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 RRP36-201ENST00000244496 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.016e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 SNX13-203ENST00000428135 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.122e-6■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 SNX13-201ENST00000409076 3818 ntTSL 27.09□□□□□ -1.272e-6■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.542e-6■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 CC2D1A-203ENST00000586955 2743 ntTSL 1 (best)11.84□□□□□ -0.511e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 CC2D1A-208ENST00000589606 3117 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.61e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.611e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 SRPK1-203ENST00000373821 565 ntTSL 50.26□□□□□ -2.374e-9■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.451e-7■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 LYPLA1-206ENST00000519891 559 ntTSL 411.53□□□□□ -0.561e-7■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 RSRP1-222ENST00000570063 1821 ntTSL 513.71□□□□□ -0.226e-12■■■■■ 30.4
Retrieved 100 of 73,762 protein–RNA pairs in 1147.7 ms