Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK5Q16478 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK5Q16478 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK5Q16478 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK5Q16478 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK5Q16478 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK5Q16478 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK5Q16478 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK5Q16478 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK5Q16478 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK5Q16478 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK5Q16478 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK5Q16478 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK5Q16478 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK5Q16478 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK5Q16478 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK5Q16478 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK5Q16478 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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GRIK5Q16478 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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GRIK5Q16478 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK5Q16478 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK5Q16478 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK5Q16478 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK5Q16478 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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GRIK5Q16478 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK5Q16478 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK5Q16478 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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GRIK5Q16478 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK5Q16478 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK5Q16478 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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GRIK5Q16478 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK5Q16478 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK5Q16478 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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GRIK5Q16478 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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GRIK5Q16478 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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GRIK5Q16478 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK5Q16478 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK5Q16478 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK5Q16478 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK5Q16478 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK5Q16478 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK5Q16478 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK5Q16478 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK5Q16478 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK5Q16478 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GRIK5Q16478 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GRIK5Q16478 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GRIK5Q16478 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GRIK5Q16478 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GRIK5Q16478 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GRIK5Q16478 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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