Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CRATP43155 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRATP43155 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRATP43155 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRATP43155 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CRATP43155 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRATP43155 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRATP43155 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRATP43155 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRATP43155 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRATP43155 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRATP43155 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRATP43155 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRATP43155 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRATP43155 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRATP43155 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRATP43155 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRATP43155 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CRATP43155 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRATP43155 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRATP43155 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRATP43155 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRATP43155 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRATP43155 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRATP43155 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRATP43155 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRATP43155 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRATP43155 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRATP43155 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRATP43155 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRATP43155 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRATP43155 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CRATP43155 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRATP43155 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRATP43155 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRATP43155 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRATP43155 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRATP43155 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRATP43155 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRATP43155 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRATP43155 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRATP43155 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRATP43155 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRATP43155 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRATP43155 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRATP43155 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRATP43155 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRATP43155 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRATP43155 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRATP43155 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRATP43155 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRATP43155 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRATP43155 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRATP43155 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRATP43155 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRATP43155 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRATP43155 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRATP43155 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRATP43155 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRATP43155 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRATP43155 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRATP43155 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRATP43155 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRATP43155 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRATP43155 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CRATP43155 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CRATP43155 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRATP43155 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRATP43155 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRATP43155 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRATP43155 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRATP43155 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRATP43155 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRATP43155 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRATP43155 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRATP43155 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRATP43155 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRATP43155 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRATP43155 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRATP43155 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRATP43155 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRATP43155 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRATP43155 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRATP43155 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRATP43155 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRATP43155 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRATP43155 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRATP43155 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRATP43155 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRATP43155 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRATP43155 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRATP43155 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRATP43155 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRATP43155 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRATP43155 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRATP43155 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRATP43155 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRATP43155 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CRATP43155 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRATP43155 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms