Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXA5P20719 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms