Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms