Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM6AO15550 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms