Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SERINC4A6NH21 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms