Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X1

SERP1, Stress-associated endoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERP1Q9Y6X1 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SERP1Q9Y6X1 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms