Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ROPN1BQ9BZX4 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ROPN1BQ9BZX4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms