Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms