Protein–RNA interactions for Protein: Q96FN4

CPNE2, Copine-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE2Q96FN4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPNE2Q96FN4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms