Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND24

RNF214, RING finger protein 214, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF214Q8ND24 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF214Q8ND24 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RNF214Q8ND24 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RNF214Q8ND24 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RNF214Q8ND24 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RNF214Q8ND24 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
RNF214Q8ND24 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RNF214Q8ND24 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RNF214Q8ND24 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RNF214Q8ND24 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RNF214Q8ND24 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RNF214Q8ND24 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF214Q8ND24 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF214Q8ND24 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF214Q8ND24 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF214Q8ND24 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF214Q8ND24 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF214Q8ND24 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF214Q8ND24 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF214Q8ND24 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF214Q8ND24 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF214Q8ND24 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF214Q8ND24 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF214Q8ND24 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF214Q8ND24 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF214Q8ND24 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF214Q8ND24 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF214Q8ND24 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF214Q8ND24 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF214Q8ND24 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF214Q8ND24 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF214Q8ND24 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF214Q8ND24 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF214Q8ND24 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF214Q8ND24 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF214Q8ND24 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF214Q8ND24 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RNF214Q8ND24 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RNF214Q8ND24 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms