Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TXNRD1Q16881 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms