Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RESTQ13127 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RESTQ13127 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RESTQ13127 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RESTQ13127 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RESTQ13127 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RESTQ13127 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RESTQ13127 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RESTQ13127 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RESTQ13127 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RESTQ13127 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RESTQ13127 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RESTQ13127 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RESTQ13127 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RESTQ13127 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RESTQ13127 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RESTQ13127 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RESTQ13127 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RESTQ13127 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RESTQ13127 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RESTQ13127 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RESTQ13127 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RESTQ13127 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RESTQ13127 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RESTQ13127 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RESTQ13127 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RESTQ13127 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RESTQ13127 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RESTQ13127 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RESTQ13127 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RESTQ13127 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RESTQ13127 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RESTQ13127 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RESTQ13127 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RESTQ13127 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RESTQ13127 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RESTQ13127 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RESTQ13127 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RESTQ13127 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RESTQ13127 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RESTQ13127 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RESTQ13127 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RESTQ13127 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RESTQ13127 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RESTQ13127 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RESTQ13127 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RESTQ13127 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RESTQ13127 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RESTQ13127 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RESTQ13127 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RESTQ13127 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RESTQ13127 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RESTQ13127 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RESTQ13127 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RESTQ13127 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RESTQ13127 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RESTQ13127 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RESTQ13127 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
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RESTQ13127 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RESTQ13127 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RESTQ13127 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RESTQ13127 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RESTQ13127 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RESTQ13127 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RESTQ13127 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RESTQ13127 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RESTQ13127 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RESTQ13127 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RESTQ13127 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RESTQ13127 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RESTQ13127 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RESTQ13127 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RESTQ13127 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RESTQ13127 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RESTQ13127 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RESTQ13127 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RESTQ13127 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RESTQ13127 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RESTQ13127 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RESTQ13127 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RESTQ13127 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RESTQ13127 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RESTQ13127 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RESTQ13127 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RESTQ13127 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
RESTQ13127 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RESTQ13127 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RESTQ13127 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RESTQ13127 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RESTQ13127 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RESTQ13127 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RESTQ13127 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RESTQ13127 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RESTQ13127 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RESTQ13127 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RESTQ13127 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RESTQ13127 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RESTQ13127 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RESTQ13127 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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