Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
RESTQ13127 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.76■■■■□ 3.8
RESTQ13127 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
RESTQ13127 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
RESTQ13127 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
RESTQ13127 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
RESTQ13127 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
RESTQ13127 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC37.59■■■■□ 3.61
RESTQ13127 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
RESTQ13127 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
RESTQ13127 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
RESTQ13127 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
RESTQ13127 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
RESTQ13127 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
RESTQ13127 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
RESTQ13127 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
RESTQ13127 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
RESTQ13127 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
RESTQ13127 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
RESTQ13127 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
RESTQ13127 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
RESTQ13127 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC36.09■■■■□ 3.37
RESTQ13127 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
RESTQ13127 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
RESTQ13127 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
RESTQ13127 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
RESTQ13127 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
RESTQ13127 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
RESTQ13127 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
RESTQ13127 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
RESTQ13127 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
RESTQ13127 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
RESTQ13127 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
RESTQ13127 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
RESTQ13127 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
RESTQ13127 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
RESTQ13127 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
RESTQ13127 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
RESTQ13127 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
RESTQ13127 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
RESTQ13127 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
RESTQ13127 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
RESTQ13127 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
RESTQ13127 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
RESTQ13127 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
RESTQ13127 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
RESTQ13127 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
RESTQ13127 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
RESTQ13127 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
RESTQ13127 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
RESTQ13127 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
RESTQ13127 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
RESTQ13127 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
RESTQ13127 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
RESTQ13127 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
RESTQ13127 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
RESTQ13127 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
RESTQ13127 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
RESTQ13127 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
RESTQ13127 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RESTQ13127 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
RESTQ13127 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
RESTQ13127 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RESTQ13127 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RESTQ13127 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RESTQ13127 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RESTQ13127 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RESTQ13127 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RESTQ13127 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RESTQ13127 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RESTQ13127 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RESTQ13127 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RESTQ13127 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RESTQ13127 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
RESTQ13127 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RESTQ13127 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
RESTQ13127 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RESTQ13127 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RESTQ13127 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RESTQ13127 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RESTQ13127 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RESTQ13127 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RESTQ13127 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
RESTQ13127 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RESTQ13127 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
RESTQ13127 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
RESTQ13127 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
RESTQ13127 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
RESTQ13127 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
RESTQ13127 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RESTQ13127 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
RESTQ13127 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RESTQ13127 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RESTQ13127 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RESTQ13127 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
RESTQ13127 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
RESTQ13127 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RESTQ13127 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
RESTQ13127 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
RESTQ13127 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
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