Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 ZNF385A-211ENST00000550779 2099 ntTSL 517.06■□□□□ 0.321e-7■□□□□ 10.7
ILF3Q12906 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.291e-7■□□□□ 10.7
ILF3Q12906 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.141e-7■□□□□ 10.7
ILF3Q12906 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.111e-7■□□□□ 10.7
ILF3Q12906 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.081e-7■□□□□ 10.7
ILF3Q12906 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.181e-7■□□□□ 10.7
ILF3Q12906 YWHAQ-203ENST00000446619 665 ntTSL 320.8■□□□□ 0.923e-6■□□□□ 10.7
ILF3Q12906 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.263e-6■□□□□ 10.7
ILF3Q12906 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.373e-6■□□□□ 10.7
ILF3Q12906 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.234e-6■□□□□ 10.7
ILF3Q12906 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.114e-6■□□□□ 10.7
ILF3Q12906 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.172e-6■□□□□ 10.7
ILF3Q12906 KDM4B-206ENST00000588361 3039 ntTSL 214.07□□□□□ -0.162e-6■□□□□ 10.7
ILF3Q12906 KDM4B-208ENST00000589104 3470 ntTSL 212.3□□□□□ -0.442e-6■□□□□ 10.7
ILF3Q12906 KDM4B-207ENST00000588961 560 ntTSL 48.36□□□□□ -1.072e-6■□□□□ 10.7
ILF3Q12906 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.86e-7■□□□□ 10.7
ILF3Q12906 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.076e-7■□□□□ 10.7
ILF3Q12906 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.066e-7■□□□□ 10.7
ILF3Q12906 CRK-203ENST00000572145 830 ntTSL 39.79□□□□□ -0.846e-7■□□□□ 10.7
ILF3Q12906 SEC31A-212ENST00000503226 613 ntTSL 34.59□□□□□ -1.672e-11■□□□□ 10.6
ILF3Q12906 ATP11A-206ENST00000419631 2446 ntTSL 312.33□□□□□ -0.443e-17■□□□□ 10.6
ILF3Q12906 ATP11A-217ENST00000614170 3542 nt9.21□□□□□ -0.943e-17■□□□□ 10.6
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ILF3Q12906 FLOT2-205ENST00000580313 429 ntTSL 37.92□□□□□ -1.142e-11■□□□□ 10.6
ILF3Q12906 FAAP20-210ENST00000440825 855 ntTSL 327.6■■■□□ 2.013e-10■□□□□ 10.6
ILF3Q12906 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.943e-10■□□□□ 10.6
ILF3Q12906 FAAP20-207ENST00000420515 1544 ntTSL 1 (best)26.68■■□□□ 1.863e-10■□□□□ 10.6
ILF3Q12906 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.663e-10■□□□□ 10.6
ILF3Q12906 FAAP20-201ENST00000378543 569 ntTSL 223.39■■□□□ 1.333e-10■□□□□ 10.6
ILF3Q12906 FAAP20-206ENST00000414253 2216 ntTSL 222.64■■□□□ 1.213e-10■□□□□ 10.6
ILF3Q12906 FAAP20-203ENST00000400918 811 ntTSL 222.24■■□□□ 1.153e-10■□□□□ 10.6
ILF3Q12906 FAAP20-209ENST00000428120 2313 ntTSL 1 (best)22.05■■□□□ 1.123e-10■□□□□ 10.6
ILF3Q12906 FAAP20-205ENST00000401813 2543 ntTSL 1 (best)17.56■□□□□ 0.43e-10■□□□□ 10.6
ILF3Q12906 FAAP20-211ENST00000469733 2280 ntTSL 216.22■□□□□ 0.193e-10■□□□□ 10.6
ILF3Q12906 FAAP20-213ENST00000487186 3576 ntTSL 212.89□□□□□ -0.353e-10■□□□□ 10.6
ILF3Q12906 METTL7A-204ENST00000550097 1846 ntTSL 514.34□□□□□ -0.118e-10■□□□□ 10.6
ILF3Q12906 METTL7A-202ENST00000547104 1825 ntTSL 1 (best)12.61□□□□□ -0.398e-10■□□□□ 10.6
ILF3Q12906 METTL7A-201ENST00000332160 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.038e-10■□□□□ 10.6
ILF3Q12906 METTL7A-203ENST00000548553 4076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.068e-10■□□□□ 10.6
ILF3Q12906 CEP350-202ENST00000367607 13491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.661e-7■□□□□ 10.6
ILF3Q12906 CEP350-205ENST00000429851 6096 ntTSL 1 (best)5.26□□□□□ -1.571e-7■□□□□ 10.6
ILF3Q12906 PPP4R3A-203ENST00000554511 580 ntTSL 317.93■□□□□ 0.461e-6■□□□□ 10.6
ILF3Q12906 PPP4R3A-211ENST00000557018 534 ntTSL 517.07■□□□□ 0.321e-6■□□□□ 10.6
ILF3Q12906 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.141e-6■□□□□ 10.6
ILF3Q12906 PPP4R3A-202ENST00000554390 2953 ntTSL 1 (best)15.43■□□□□ 0.061e-6■□□□□ 10.6
ILF3Q12906 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.061e-6■□□□□ 10.6
ILF3Q12906 PPP4R3A-207ENST00000555029 571 ntTSL 514.07□□□□□ -0.161e-6■□□□□ 10.6
ILF3Q12906 PPP4R3A-201ENST00000554308 2515 ntTSL 513.83□□□□□ -0.21e-6■□□□□ 10.6
ILF3Q12906 PPP4R3A-206ENST00000554943 3369 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.561e-6■□□□□ 10.6
ILF3Q12906 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.32e-6■□□□□ 10.6
ILF3Q12906 MOB1B-205ENST00000511449 627 ntTSL 316.94■□□□□ 0.32e-6■□□□□ 10.6
ILF3Q12906 MOB1B-203ENST00000502869 760 ntTSL 316.02■□□□□ 0.162e-6■□□□□ 10.6
ILF3Q12906 MOB1B-204ENST00000509041 2056 ntTSL 211.67□□□□□ -0.542e-6■□□□□ 10.6
ILF3Q12906 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.432e-6■□□□□ 10.6
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ILF3Q12906 PEG3-210ENST00000600833 1558 ntTSL 1 (best)9.15□□□□□ -0.952e-8■□□□□ 10.6
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ILF3Q12906 LEPROT-201ENST00000371065 4622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.488e-8■□□□□ 10.6
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ILF3Q12906 IQSEC2-206ENST00000638521 4501 ntAPPRIS ALT2 TSL 510.74□□□□□ -0.698e-8■□□□□ 10.6
ILF3Q12906 LEPROT-204ENST00000488747 345 ntTSL 510.53□□□□□ -0.728e-8■□□□□ 10.6
ILF3Q12906 IQSEC2-209ENST00000638869 3000 ntTSL 59.32□□□□□ -0.928e-8■□□□□ 10.6
ILF3Q12906 RPS8-203ENST00000464658 898 ntTSL 29.19□□□□□ -0.942e-8■□□□□ 10.6
ILF3Q12906 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.468e-8■□□□□ 10.6
ILF3Q12906 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.538e-8■□□□□ 10.6
ILF3Q12906 LEPROT-203ENST00000484243 549 ntTSL 34.55□□□□□ -1.688e-8■□□□□ 10.6
ILF3Q12906 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.968e-8■□□□□ 10.6
ILF3Q12906 SEMA4B-218ENST00000561085 582 ntTSL 422.79■■□□□ 1.245e-6■□□□□ 10.6
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ILF3Q12906 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.325e-6■□□□□ 10.6
ILF3Q12906 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.772e-7■□□□□ 10.6
ILF3Q12906 U2AF2-208ENST00000592874 849 ntTSL 516.62■□□□□ 0.252e-7■□□□□ 10.6
ILF3Q12906 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.22e-7■□□□□ 10.6
ILF3Q12906 RBL1-204ENST00000527999 599 ntTSL 520.85■□□□□ 0.931e-6■□□□□ 10.6
ILF3Q12906 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.228e-10■□□□□ 10.6
ILF3Q12906 ETNK1-203ENST00000538218 1659 ntTSL 1 (best)16.34■□□□□ 0.218e-10■□□□□ 10.6
ILF3Q12906 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.31e-6■□□□□ 10.6
ILF3Q12906 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.311e-6■□□□□ 10.6
ILF3Q12906 ETNK1-201ENST00000266517 7159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.498e-10■□□□□ 10.6
ILF3Q12906 YWHAQ-205ENST00000474715 709 ntTSL 33.95□□□□□ -1.783e-6■□□□□ 10.6
ILF3Q12906 C22orf34-205ENST00000416411 542 ntTSL 413.65□□□□□ -0.229e-7■□□□□ 10.5
ILF3Q12906 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.289e-7■□□□□ 10.5
ILF3Q12906 SS18L1-205ENST00000492466 899 ntTSL 514.54□□□□□ -0.081e-7■□□□□ 10.5
ILF3Q12906 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.796e-16■□□□□ 10.5
ILF3Q12906 CBFB-204ENST00000563939 545 ntTSL 419.11■□□□□ 0.654e-6■□□□□ 10.5
ILF3Q12906 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.524e-6■□□□□ 10.5
ILF3Q12906 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.46e-16■□□□□ 10.5
ILF3Q12906 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.184e-6■□□□□ 10.5
ILF3Q12906 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.064e-6■□□□□ 10.5
ILF3Q12906 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.014e-6■□□□□ 10.5
ILF3Q12906 SLC9A3R1-204ENST00000581356 519 ntTSL 312.61□□□□□ -0.396e-16■□□□□ 10.5
ILF3Q12906 GREB1-202ENST00000263834 2448 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.854e-6■□□□□ 10.5
ILF3Q12906 GREB1-203ENST00000381483 2347 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.924e-6■□□□□ 10.5
ILF3Q12906 GREB1-208ENST00000470980 833 ntTSL 38.99□□□□□ -0.974e-6■□□□□ 10.5
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