Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VBP1P61758 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VBP1P61758 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VBP1P61758 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VBP1P61758 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VBP1P61758 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VBP1P61758 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VBP1P61758 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VBP1P61758 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VBP1P61758 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VBP1P61758 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VBP1P61758 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VBP1P61758 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VBP1P61758 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VBP1P61758 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VBP1P61758 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VBP1P61758 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VBP1P61758 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VBP1P61758 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VBP1P61758 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VBP1P61758 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VBP1P61758 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VBP1P61758 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VBP1P61758 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VBP1P61758 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VBP1P61758 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VBP1P61758 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VBP1P61758 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VBP1P61758 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VBP1P61758 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VBP1P61758 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VBP1P61758 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VBP1P61758 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VBP1P61758 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VBP1P61758 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VBP1P61758 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VBP1P61758 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VBP1P61758 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VBP1P61758 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VBP1P61758 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VBP1P61758 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VBP1P61758 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VBP1P61758 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VBP1P61758 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VBP1P61758 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VBP1P61758 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VBP1P61758 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VBP1P61758 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VBP1P61758 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VBP1P61758 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VBP1P61758 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VBP1P61758 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VBP1P61758 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VBP1P61758 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VBP1P61758 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VBP1P61758 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VBP1P61758 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VBP1P61758 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VBP1P61758 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VBP1P61758 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VBP1P61758 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VBP1P61758 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VBP1P61758 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VBP1P61758 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
VBP1P61758 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VBP1P61758 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
VBP1P61758 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VBP1P61758 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VBP1P61758 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VBP1P61758 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VBP1P61758 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VBP1P61758 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
VBP1P61758 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VBP1P61758 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VBP1P61758 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VBP1P61758 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VBP1P61758 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VBP1P61758 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VBP1P61758 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VBP1P61758 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VBP1P61758 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VBP1P61758 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VBP1P61758 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VBP1P61758 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VBP1P61758 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VBP1P61758 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VBP1P61758 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VBP1P61758 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VBP1P61758 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VBP1P61758 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VBP1P61758 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VBP1P61758 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VBP1P61758 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VBP1P61758 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VBP1P61758 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VBP1P61758 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VBP1P61758 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VBP1P61758 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VBP1P61758 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VBP1P61758 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms