Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRA4P48169 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms