Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPC1P35052 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPC1P35052 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPC1P35052 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPC1P35052 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPC1P35052 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPC1P35052 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPC1P35052 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GPC1P35052 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPC1P35052 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GPC1P35052 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GPC1P35052 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPC1P35052 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPC1P35052 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPC1P35052 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPC1P35052 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPC1P35052 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPC1P35052 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPC1P35052 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPC1P35052 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPC1P35052 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPC1P35052 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPC1P35052 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GPC1P35052 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPC1P35052 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPC1P35052 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPC1P35052 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPC1P35052 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPC1P35052 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC1P35052 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC1P35052 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC1P35052 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC1P35052 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC1P35052 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC1P35052 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC1P35052 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC1P35052 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC1P35052 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC1P35052 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC1P35052 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC1P35052 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC1P35052 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC1P35052 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC1P35052 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC1P35052 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC1P35052 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC1P35052 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC1P35052 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC1P35052 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC1P35052 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC1P35052 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC1P35052 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC1P35052 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC1P35052 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC1P35052 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC1P35052 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC1P35052 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC1P35052 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC1P35052 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPC1P35052 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC1P35052 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC1P35052 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC1P35052 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC1P35052 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC1P35052 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC1P35052 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC1P35052 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC1P35052 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC1P35052 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC1P35052 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC1P35052 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC1P35052 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC1P35052 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC1P35052 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC1P35052 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC1P35052 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC1P35052 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC1P35052 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC1P35052 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC1P35052 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC1P35052 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC1P35052 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC1P35052 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPC1P35052 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPC1P35052 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPC1P35052 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPC1P35052 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPC1P35052 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPC1P35052 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPC1P35052 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPC1P35052 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPC1P35052 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPC1P35052 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPC1P35052 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPC1P35052 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
GPC1P35052 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC1P35052 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC1P35052 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC1P35052 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC1P35052 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms