Protein–RNA interactions for Protein: O75841

UPK1B, Uroplakin-1b, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK1BO75841 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UPK1BO75841 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms