Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC90BQ9GZT6 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms