Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV29

CCDC32, Coiled-coil domain-containing protein 32, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC32Q9BV29 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms