Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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PCM1Q15154 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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PCM1Q15154 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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PCM1Q15154 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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PCM1Q15154 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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PCM1Q15154 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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PCM1Q15154 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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PCM1Q15154 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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PCM1Q15154 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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PCM1Q15154 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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PCM1Q15154 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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PCM1Q15154 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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PCM1Q15154 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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PCM1Q15154 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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PCM1Q15154 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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PCM1Q15154 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
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