Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCARF1Q14162 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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